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消毒药物的选择要有针对性，要根据消毒的目的、对象、疫病流行趋势，依据高效、广谱、经济、副作用小的原则选择药物。市场上消毒药物品种繁多，要选用有一定规模的、信誉较好的厂家的产品，关键要注意消毒药物的有效成份和含量、生产日期、使用方法。目前常用的有以下几类：氯类副作用小，温度越高、杀菌力越强，多作饮水消毒；季胺盐类，对革兰氏阳性菌有较强的杀灭作用，多作棚舍、设备的消毒；甲醛对细菌、病毒均有效，但作用缓慢，有腐蚀性，多作棚舍的消毒。
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