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当牛球虫寄生在大肠内繁殖时，肠黏膜上皮大量破坏脱落、黏膜出血并形成溃疡；这时在临床上表现为出血性肠炎、腹痛，血便中常带有黏膜碎片。约1周后，前胃迟缓，肠蠕动增强、下痢，多因体液过度消耗而死亡。
防治方法：1.分群饲养，以免球虫卵囊污染犊牛的饲料。2.饲牛的粪便和垫草需集中消毒或进行生物热堆肥发酵，在发病时可用1%克辽林对牛舍、饲槽消毒，每周一次。3.丙啉，按每千克体重20～50毫克，一次内服，连用5～6天；盐霉素，每天每千克体重2毫克，连用7天。
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